一条完整的精子，包括头、颈、中段、主段和末段。由于通过光学显微镜很难观察到精子末段，因此可以认为精子是由头(和颈)和尾(中段和主段)组成。对于正常和异常精子的判断，研究人员通常是依据精子头部和尾部的诸多特征，人为设定临界标准来界定。
正常精子通常有以下特征：头部外形光滑，大体为椭圆形;顶体区占头部40%-70%，没有大空泡;尾部没有显示鞭毛折断的锐利折角，主段可以自身卷曲成环状的精子。而畸形精子一般在头部和尾部有缺陷。
精子正常形态率小于4% 即可诊断为畸形精子症。但需要强调的是，即使是生育力正常的男性，其精液标本中也含有大量畸形的精子。
不少研究认为，畸形精子一般会导致较低的受精潜能，世卫组织也将精子形态作为评估男性生育潜能的工具。但大部分“畸形精子症”患者仍然可以自然生育，单纯的精子畸形率高也不会导致流产率和胎儿畸形率升高。
造成精子形态缺陷的可能因素有很多，一种是遗传性的精子形态缺陷，比如圆头精子症、短尾症等;另一种是非遗传性的精子形态异常。
畸形精子与什么有关？一般来说，可能与下面几个原因有关：
1、生殖道感染：如细菌、支原体、衣原体、病毒等都可能引起精子畸形率的提高;
2、理化因素：空气污染、职业接触、生活习惯等周围环境异常，对精子形态及活动力均可产生负面影响;
3、某些种类的抗癌药、抗生素、抗躁狂药等，以及长期接触农药(杀虫剂)均会影响精子的发育。
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